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修飾磷酸應(yīng)用舉例:SELEX適配體文庫(kù)篩選

2021-04-28
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作為全球領(lǐng)先的核酸修飾專(zhuān)家,TriLink 的修飾性核苷酸在用于藥物研發(fā)的各種技術(shù)中也應(yīng)用廣泛,SELEX技術(shù)便是其中之一。


SELEX,即指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進(jìn)化技術(shù)(Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment,SELEX),是一項(xiàng)用于篩選核酸適配體(Aptamer)的技術(shù)。核酸適配體,是可與蛋白質(zhì)、金屬離子、小分子、多肽甚至整個(gè)細(xì)胞等目的靶標(biāo)進(jìn)行高親和力和特異性結(jié)合的一段寡核苷酸序列(DNARNA)。


與抗體相比,極性帶負(fù)電的核酸分子與蛋白結(jié)合時(shí)可以提供更多的氧原子,提供更多的電子對(duì)去產(chǎn)生更多的氫鍵,增加相互作用的鍵能,維持更穩(wěn)定的結(jié)構(gòu);另外,核酸適配體與抗體相比具有分子量小,穩(wěn)定性更好,易改造修飾,無(wú)免疫原性,制作周期短,可以通過(guò)人工合成等優(yōu)勢(shì),免去了動(dòng)物免疫、飼養(yǎng)、蛋白提取和純化等一系列流程。因此,核酸適配體相比抗體,在生化分析,生物醫(yī)療,新藥研發(fā)等方面都有更大的潛力。


SELEX流程:

1.?確定目的靶標(biāo)。(目標(biāo)分子可以是蛋白質(zhì),小分子或超分子結(jié)構(gòu),甚至細(xì)胞。)

2.?構(gòu)建隨機(jī)寡核苷酸(~1 x 10?15個(gè)寡核苷酸)文庫(kù)。

3.?靶標(biāo)與文庫(kù)核酸共孵育。

4.?去除未結(jié)合的核酸片段,而結(jié)合的那些片段進(jìn)行擴(kuò)增后,進(jìn)行下一輪篩選。

5.?通過(guò)該過(guò)程,將與靶標(biāo)有高親和力的寡核苷酸從數(shù)萬(wàn)億的數(shù)量中篩選出來(lái)。

6.?對(duì)最終篩選出的適配體進(jìn)行分類(lèi),純化、測(cè)序以及后期修飾。


適配體的后期修飾,可以使適配體更加穩(wěn)定性,并鞏固適配體與目的靶標(biāo)的親和力,且進(jìn)行了熒光等功能團(tuán)修飾的適配體還可以用于檢測(cè)和固定目的靶標(biāo)。Trilink2'-Fluoro-dCTP(目錄號(hào)N-1008)和2'-Fluoro-dUTP(目錄號(hào)N-1010就經(jīng)常被用于適的修飾。這些修飾類(lèi)型提高了適體的穩(wěn)定性,使其對(duì)核酸內(nèi)切酶降解的抵抗力增強(qiáng)。


由SELEX衍生的PhotoSELEX技術(shù)使用5--2'-脫氧尿苷-5'-三磷酸酯(Br-dU)(TriLink目錄號(hào)N-2008)代替標(biāo)準(zhǔn)的胸苷。除了通過(guò)空間構(gòu)象與目的靶標(biāo)結(jié)合,修飾體的Br-dU殘基和靶標(biāo)的酪氨酸之間也存在共價(jià)鍵。Br-dU修飾的寡核苷酸暴露于輻射中時(shí),處于正確構(gòu)象的寡核苷酸靶分子上的特定位點(diǎn)共價(jià)交聯(lián)。該技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的高通量檢測(cè)。


SELEX只是修飾核苷酸的眾多應(yīng)用之一。TriLink提供了可用于多種研究目的的修飾核苷酸。




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